万人のためのハイパフォーマンスコンピューティング

HPC Do It Yourself Club

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HPCノウハウ

○ビデオセミナー

 

LAVAでインタラクティブなジョブをサブミットする

クラスターに必要な機能

クラスターの目的

 ●(1)並列化で高速実行
 ●(2)ジョブスケジューラで複数ジョブを最短実行

 

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コンピュータ・クラスター入門

 

 1. クラスターとは
 2. クラスターの使い方
 3. クラスターの構成要素
  3.1 OS (Operating System)
  3.2 NFS (Network File System)
  3.3 NIS (Network Information System)
  3.4 MPI (Message Passing Interface)
  3.5 ジョブスケジューラ
 4. インフィニバンドとは

 5. クラスターの組み立て手順
  5.1 1Uサーバーの組み立て手順
 6. クラスターインストールUSBツール解説書
 7. 新世代Xeonプロセッサ SandyBridge EPについて 
 8. エージングテストとは
 9. ちょっと役に立つHPC虎の巻
 10. HPC Do It Yourself Club 別館


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ドキュメント

 

HPCDIYC製品取扱説明書


HPCクラスター構築


クラスターインストールUSB


Lavaをインストールする


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ムービー

 

LAVAでインタラクティブなジョブをサブミットする

クラスターに必要な機能

クラスターの目的

 ●(1)並列化で高速実行
 ●(2)ジョブスケジューラで複数ジョブを最短実行

 

SSDを使ってRAIDを構成し性能を測定してみた

 ●ホットプラグ可能な3.5インチHDDマウンターに2.5インチSSDを取り付けるには
 ●SSD単体ではread273MB/s、write233MB/sとなった
 ●MB上のチップセットを使ったRAIDではread512MB/s、write466MB/sとなった
 ●RAIDコントローラーのRAID0ではread569MB/s、write406MB/sとなった

 

 ●2種類のワークステーション、SWSとD8WSの違い

 

 ●Restore USBを使って出荷時の状態に戻す

 

LAVA入門

 ●ジョブのサブミットと結果の表示
 ●沢山のジョブを投入する
 ●ジョブをkillする
 ●ジョブの順序を入れ替える

 

LAVAのカスタマイズ

 ●LAVAでジョブを流さないコンピュータを指定する方法
 ●ジョブが実行されるコンピュータの優先度を設定する

 

MPIジョブのLAVAを使った実行方法

 ●姫野ベンチを16コアでMPI実行する
 ●2台のコンピュータ32コアでMPI実行する
 ●32コアの姫野ベンチをLAVAを使って実行する
 ●16コアから128コアまでの姫野ベンチをLAVAで実行する

 

出荷時のクラスター設定

 ●製品の説明
 ●ケーブルをつなぐ
 ●外部接続用IPアドレスの確認
 ●VNCサーバーに接続
 ●MPIを使ってみる
 ●LAVA(ジョブスケジューラ)を使ってみる
 ●新規ユーザーを登録する
 ●新規ユーザーでVNCを使う
 ●UPSの自動シャットダウン

 

Silent Workstation標準搭載の機能を使ってハードウェアRAIDを構成する

 ●ハードディスクを取り付ける
 ●ハードウェアRAIDを構成する 1/2
 ●ハードウェアRAIDを構成する 2/2

 

セミナー

 ●プライベートセミナー
 ●クラスターDIYセミナー

 

製品紹介

 ●HPCDIY-WS サイレントワークステーション
 ●HPCDIY-2U2CPU 2Uサーバー
 ●サイレントワークステーションと2Uサーバーの比較


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最新トピックス

 

Berkeley Lab Checkpoint/Restart (BLCR) をインストールして試す


OpenMPIをInfiniBand用にconfigureとmakeし、通信速度を計測する


ノマド+コピペでできる、バーチャルHPC Linuxクラスター構築

 (1)準備

 (2)バーチャルマシンにCentOS6.3をインストール

 (3)ノード間で共通の設定を行う(CentOS6.3)

 (4)hpc01をコピーしてhpc02を作る

 (5)NFSとNISを設定する

 (6)Lavaをインストールする


Lavaとmpirunとのインターフェース、openmpi-mpirunについて少し掘り下げる


mpirunでrankを自由に配置する方法


InfiniBand QDR vs. Gb Ethernet

 その1: 基本性能を測定する

 その2:姫野ベンチで性能比較

 その3の1:NFSでの速度比較 はじめに

 その3の2:NFSでの速度比較 IPOIBの設定

 その3の3:NFSでの速度比較 IPOIBでNFS Auto Mount

 その3の4:NFSでの速度比較 Readで

 その3の最後:NFSでの速度比較 Writeで


E5-2600シリーズはNUMA、NUMAで性能を出すには

 その1: NUMAとは

 その2: CPUの割り当てを変更して性能を出す

 その3: interleaveで性能を出す

 その4: MPIなら性能が出る

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IPMI関連

 

 ●BIOSでIPMI用IPアドレスを設定する
 ●WEBブラウザでIPMIにアクセスする
 ●KVM over LANを使い、 遠隔操作で、BIOS設定、OSインストール
 ●IPMIで消費電力計測と最大消費電力の規制
 ●フル稼働のコア数を変えて、IPMIで消費電力を計測する
 ●Power Cappingで消費電力を制御する


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CPUの性能比較

 

 ●E5-2687W vs. E5-2690
 ●E5−2690 vs. E5−2687W Linpack速報

 ●E5-2690、E5-2687W、E5-2643ベンチマーク比較


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